Der Fährhafen Agathonisi liegt auf der nördlichsten Insel des Dodekanes mit etwa 200 Einwohnern. Dodekanisos Seaways betreibt wöchentlich etwa 4 Verbindungen von Pythagorio auf Samos, die Überfahrt dauert nur 35 Minuten. Weitere Verbindungen bestehen nach Patmos, Lipsi und Leros.