SAOS Ferries wurde 1975 von Einwohnern der Insel Samothraki gegründet und ist nach dem höchsten Berg der Insel (Berg Saos) benannt. Das Unternehmen hat seinen Sitz in Alexandroupolis in Thrakien und betreibt heute mit drei Schiffen Routen zu den Dodekanes- und Kykladen-Inseln.
Nach vielen Jahren, in denen SAOS Ferries nur Routen nach Samothraki und zu den Sporaden anbot, verbindet das Unternehmen heute auch die beliebten Inseln der Dodekanes und der Kykladen. Die Ziele umfassen Kalymnos, Leros, Leipsoi, Patmos, Arkioi, Agathonisi, Samos Pythagoreio, Rhodos, Halki, Symi, Tilos, Nisyros und Kos.
Die Flotte besteht aus zwei Fähren und einem Schnellboot: Die Saonisos (Baujahr 1994) kann 341 Passagiere und 50 Fahrzeuge befördern und verkehrt auf den Kykladen. Die Stavros (Baujahr 2000) fasst 587 Passagiere und 100 Fahrzeuge und bedient die Dodekanes. Das Schnellboot Zefyros bietet Innen- und Außensitzbereiche, hat jedoch keine Garage für Fahrzeuge.
Die frühere Strecke Alexandroupolis-Samothraki-Limnos, die SAOS Ferries über 20 Jahre betrieb, wird heute von Fast Ferries mit dem Schiff Adamantios Korais bedient.